1. Pilot
Yayın tarihi: 11 Eyl 1993 · 49 dakika
Genç bir FBI ajanı, diğer bir ajanı gözetlemekle görevlendirilir. Ancak çok geçmeden kendini paranormal ve açıklanamayan olayları araştırırken bulur.
2. Muhbir
Yayın tarihi: 18 Eyl 1993 · 46 dakika
Uzaylı teknolojisiyle yapılmış bir uçak uçurmuş ihtimali olan test pilotu ortadan kaybolur. Mulder ve Scully gerçekleri ortaya çıkarmak için kendi hükûmetlerine meydan okumalıdır.
3. Sıkışık
Yayın tarihi: 25 Eyl 1993 · 43 dakika
Mulder ve Scully, her 30 yolda bir cinayet çılgınlığını devam ettiren insanı andıran bir katil ararlar.
4. Aktarıcı
Yayın tarihi: 2 Eki 1993 · 45 dakika
Mulder çocukken yaşadığı bir “karşılaşma” ile yakından eşleşen bir vakayı çözmeyi takıntı haline getirir.
5. Jersey Şeytanı
Yayın tarihi: 9 Eki 1993 · 45 dakika
Mulder ve Scully, kırk yılı aşkın bir süredir New Jersey kırsalında dolaşan efsanevi bir yaratığı takip eder.
6. Gölgeler
Yayın tarihi: 23 Eki 1993 · 46 dakika
Mulder ve Scully güçlü bir psikokinetik güç tarafından öldürüldüğüne inanılan iki adamın ölümlerini araştırır.
7. Makinedeki Hayalet
Yayın tarihi: 30 Eki 1993 · 46 dakika
Cadılar Bayramı'nda Mulder ve Scully, düşünen bir bilgisayar tarafından öldürülmüş olabilecek bir şirket yöneticisinin ölümünü araştırır.
8. Buz
Yayın tarihi: 6 Kas 1993 · 46 dakika
Mulder ve Scully, Alaska'da uzak bir bölgede konuşlanmış bir genofizik ekibinin parazitik bir uzaylı yaşam formu tarafından öldürülmesini araştırmak için gönderilir.
9. Uzay
Yayın tarihi: 13 Kas 1993 · 47 dakika
Bir uzay mekiği görevi sabote edildiğinde, Mulder bunun eski bir Gemini astronotunun vücudunda yaşayan kötü bir dünya dışı ruhun işi olabileceğinden şüphelenir.
10. Düşmüş Melek
Yayın tarihi: 20 Kas 1993 · 46 dakika
Gizli Dosyalar projesinin geleceği, Mulder'ın hükûmet tarafından örtbas edilmiş gizli bir UFO kazasının yaşandığı yere sızmasıyla tehlikeye girer.
11. Eve
Yayın tarihi: 11 Ara 1993 · 46 dakika
Mulder ve Scully, babaları aynı şekilde öldürüldükten sonra kaybolan iki kızı ararlar.
12. Ateş
Yayın tarihi: 18 Ara 1993 · 46 dakika
Mulder ve Scully, pirokinetik güçlere sahip bir adamın İngiliz aristokrasisinin üyelerinin peşine düşmesinin ardından Scotland Yard'dan bir müfettiş ile güçlerini birleştirir.
13. Denizin Ötesi
Yayın tarihi: 8 Oca 1994 · 46 dakika
Scully, idam cezasına çarptırılmış bir mahkumunun psişik tahminlerinin bir kısır katili yakalamanın tek umudu olduğuna inanır.
14. Cinsiyet Değiştiren
Yayın tarihi: 22 Oca 1994 · 45 dakika
Cinsiyeti değiştirebilen dini bir mezhep üyesi, gerçekleşen seri cinayetlerde asıl şüpheli hâline gelir.
15. Lazarus
Yayın tarihi: 5 Şub 1994 · 46 dakika
Tehlikeli bir suçlunun bilinci, aynı zamanda Scully’nin eski erkek arkadaşı olan bir FBI ajanını ele geçirir.
16. Kalbi Genç
Yayın tarihi: 12 Şub 1994 · 46 dakika
Yıllar önce hapishanede öldüğüne inanılan bir suçlunun, Mulder'la çözmesi gereken bir kan davası vardır.
17. E.B.E. (Dünya Dışı Biyolojik Varlık)
Yayın tarihi: 19 Şub 1994 · 45 dakika
Mulder ve Scully, hükûmetin yabancı bir yaşam formunun gizli taşınmasının izlerinin üzerine gittiklerinde, kendilerini bitmek bilmeyen bir yanlış bilgilendirme sürecinde bulurlar.
18. Mucize Adam
Yayın tarihi: 19 Mar 1994 · 46 dakika
Ajanlar, oğlu bir dokunuşla iyileşme ve öldürme gücüne sahip bir adam tarafından yönetilen bir bakanlığı araştırır.
19. Şekiller
Yayın tarihi: 2 Nis 1994 · 46 dakika
Ajanlar, bir Kızılderili efsanesinde geçen kurt benzeri bir yaratığın peşine düşer.
20. Karanlık Çöker
Yayın tarihi: 16 Nis 1994 · 44 dakika
Uzak bir ormanda çalışan bir grup keresteci, kurbanlarını felç edip kozalayan binlerce ölümcül böcek benzeri yaratığı ortaya çıkarır.
21. Tooms
Yayın tarihi: 23 Nis 1994 · 46 dakika
Mulder'ın hapsedilmesine yardım ettiği Eugene Tooms şartlı tahliye ile serbest bırakılır.
22. Tekrar Doğmak
Yayın tarihi: 30 Nis 1994 · 45 dakika
Sekiz yaşında bir kız, bir dizi tuhaf, ilk bakışta bağlantısız duran ölümlerde baş şüpheli haline gelir.
23. Roland
Yayın tarihi: 7 May 1994 · 46 dakika
Bir havacılık araştırma laboratuvarında bulunan en iyi bilim adamlarının gizemli şekilde ölmesiyle, ajanlar, zihinsel engelli bir hademenin bir şekilde suçlu olabileceğinden şüphelenir.
24. Erlenmeyer Şişesi
Yayın tarihi: 14 May 1994 · 46 dakika
Derin Gırtlak, Mulder'ı kaçak biri ve dünya dışı virüslerin çoğaltılmasıyla ilgili bir vakaya yönlendirir.