1. İçinde
Yayın tarihi: 6 Kas 2000 · 45 dakika
Ajan John Doggett, FBI'ın Mulder'ı bulmak için başlattığı insan avını yönetmektedir. Scully ve Skinner ise meslektaşlarını bulmak için Lone Gunmen'dan edindikleri bilgiden faydalanırlar.
2. Onsuz
Yayın tarihi: 13 Kas 2000 · 45 dakika
Kayıp Gibson Praise'i arama çalışmaları devam ederken Scully, Skinner ve Doggett, FBI'ı kandırmak için suret değiştirme yeteneğini kullanan uzaylı kelle avcısıyla karşılaşırlar.
3. Sabır
Yayın tarihi: 20 Kas 2000 · 45 dakika
Scully ve Doggett, yarasa benzeri korkunç bir yaratıkla bağlantılı cinayetleri araştırmaktadır.
4. Koşucu Kuş
Yayın tarihi: 27 Kas 2000 · 45 dakika
Scully, kasaba halkının bir otostopçuya taptığı ıssız bir yerde mahsur kalır.
5. Yakarış
Yayın tarihi: 4 Ara 2000 · 45 dakika
On yıl önce kaybolan bir çocuk bir anda ortaya çıkar fakat çocuk hiç büyümemiştir.
6. Teyanic
Yayın tarihi: 11 Ara 2000 · 45 dakika
Karısını öldürmekle suçlanan bir adam, geçmiş hatalarını düzeltmesi için kendisine ikinci bir şans verildiği fark eder.
7. Negatif Biçim
Yayın tarihi: 18 Ara 2000 · 45 dakika
Doggett, kendini kurbanlarının rüyalarına yansıtabilen bir tarikat liderinin peşine düşer. Scully hastaneye yatar.
8. Kesin Ölüm
Yayın tarihi: 8 Oca 2001 · 45 dakika
Ajanlar, duvarların arkasını görebilen bir katili bulmaya çalışmaktadır.
9. Kurtarış
Yayın tarihi: 15 Oca 2001 · 45 dakika
Scully ve Doggett, kendisini o hâle getiren kişileri öldürmeyi kafaya takmış metal adamın peşine düşerler.
10. İntikam
Yayın tarihi: 22 Oca 2001 · 45 dakika
Ajanlar, insan zihnini yönlendirebilen bir Kızılderili sufinin peşine düşerler.
11. Hediye
Yayın tarihi: 5 Şub 2001 · 45 dakika
Doggett, Mulder ve efsanevi bir Kızılderili sürüngeniyle bağlantılı bir gizemi çözmeye çalışmaktadır.
12. Medusa
Yayın tarihi: 12 Şub 2001 · 45 dakika
Doggett ve bir uzman ekip, Boston metrosundaki bir tünelde gerçekleşen tuhaf ölümlerin gizemini çözmek için zamanla yarışmaktadır.
13. El Yordamı
Yayın tarihi: 19 Şub 2001 · 45 dakika
Scully kendinin ve bir başka hamile kadının uzaylı bebek doğuracağından korkmaktadır.
14. Bu Olmuyor
Yayın tarihi: 26 Şub 2001 · 45 dakika
Bir UFO'nun, kaçırılan hastalıklı kişileri tekrar yeryüzüne bırakmasının adından FBI ajanı Monica Reyes, Scully, Doggett ve Skinner, Jeremiah Smith'in peşine düşer.
15. Yaşayan Ölü
Yayın tarihi: 2 Nis 2001 · 45 dakika
Mulder defnedildikten sonra uzaylılar tarafından kaçırılan birinin cesedenin canlanması Scully ve Skinner'a umut verir.
16. Üç Kelime
Yayın tarihi: 9 Nis 2001 · 45 dakika
Amerikalı bir sayım görevlisinin uzaylı istilasıyla ilgili Beyaz Saray'ı uyarmaya çalışması, Mulder'ı bir bilgi işlem merkezindeki verilere ulaşmaya teşvik eder.
17. Empedocles
Yayın tarihi: 16 Nis 2001 · 45 dakika
Ajanlar, Doggett'ın oğlunun yıllar önceki ölümüyle bir bağlantısı olabilecek, kötü varlıkların ele geçirdiği bir adamın izini sürer.
18. Geliyorlar
Yayın tarihi: 23 Nis 2001 · 45 dakika
Mulder ve Doggett, gizemli kara yağ virüsü taşıyan mürettebat üyelerinin bulunduğu bir petrol platformunda mahsur kalır.
19. Yalnız
Yayın tarihi: 7 May 2001 · 45 dakika
Mulder, ölümcül bir sürüngen canavarla mahsur kalan Doggett ve yeni ortağını bulmaya çalışır.
20. Öz
Yayın tarihi: 14 May 2001 · 45 dakika
Bir türlü durdurulamayan Billy Miles, genetik araştırma yürüten bilim insanlarını öldürmeye başlar. Daha sonra Scully'yi hedef alır.
21. Varoluş
Yayın tarihi: 21 May 2001 · 45 dakika
Billy Miles ile FBI çalışanları arasında bir bağ olduğu ortaya çıkınca Mulder olayı sorgular. Scully doğum yapmaya hazırlanırken Reyes ile birlikte ıssız bir yere sığınırlar.